O atacante é natural de Osasco (SP), e sua carreira teve início precoce. Já aos 10 anos de idade assinou contrato com o Santos, sendo a partir de então um dos grandes destaques das categorias de base do clube.
Após seis anos jogando do sub-13 ao sub-17, Rodrygo estreou entre os profissionais em 2017. Com apenas um ano no time principal, o atacante teve destaque suficiente para ser negociado por 50 milhões de euros com o Real Madrid.
Curiosidade: Em 15 de março de 2018, Rodrygo marcou o segundo gol da vitória do Santos sobre o Nacional (Uruguai) e se tornou o brasileiro mais jovem a marcar um gol na Copa Libertadores da América.